Zune yazılımı Zune ile birlikte gelir ve ücretsiz olarak indirilebilir. Zune'daki içeriği yönetmenin birincil yöntemi olması amaçlanan resmi Zune yazılımı, Zune ayarlarını değiştirmenize, dosya eklemenize veya silmenize ve Zune ürün yazılımını güncellemenize olanak tanır. Zune yazılımını kullanmak istemiyorsanız, Zune'a müzik aktarmak için bilgisayarınızın Windows Media Player sürümünü kullanabilirsiniz. Zune yalnızca WMA ve MP3 ses biçimlerini desteklerken, Windows Media Player uyumsuz dosyaları otomatik olarak Zune için oynatılabilir bir biçime dönüştürür.
Windows Media Player'ı başlatın. Sağlanan Zune eşitleme kablosunu kullanarak Zune'u bilgisayarınıza bağlayın.
Windows Media Player'ın sağ üst köşesindeki "Senk" düğmesini tıklayın.
Zune'da olmasını istediğiniz şarkıları Senkronizasyon düğmesinin altındaki "Liste" bölümüne sürükleyip bırakın. Windows Media Player kitaplığındaki şarkılara "Kütüphane" düğmesine tıklayarak, aktarmak istediğiniz şarkılara sağ tıklayarak ve "Listeye ekle" seçeneğine tıklayarak erişebilirsiniz.
"Senkronizasyonu Başlat" düğmesini tıklayın. Listede uyumsuz dosyalar varsa, Zune'a aktarılmadan önce dönüştürülürler.