Mikroskoplar ve Petri kaplarına ek olarak, bilgisayarlar mikrobiyologlar için önemli bir araçtır. Mikrobiyoloji araştırmaları için yazılımlar, diğer bilimsel ve mühendislik disiplinleri tarafından kullanılan araçları ve ayrıca bakteri ve diğer mikroorganizmaların incelenmesi için özel uygulamaları içerir. Devlet kurumları, kar amacı gütmeyen kuruluşlar veya akademik araştırmacılar tarafından geliştirilen birçok uygulama, deney veya laboratuvarınızın gerektirdiği şekilde indirip kullanabileceğiniz ücretsiz yazılımlar olarak mevcuttur.
Görselleştirme Araçları
Topladığınız ham verilerin fiziksel veya zihinsel bir resmi, kalitesini, önemini ve sonuçlarını daha iyi anlamanıza yardımcı olabilir. Açık kaynak ve ticari veri görselleştirme yazılımı, mikrobiyoloji araştırmaları için yaygın olarak mevcuttur. LibreOffice Calc, Microsoft Excel veya Mondrian veri görselleştirme sistemini kullanarak verilerinizin çizelgelerini ve grafiklerini oluşturun. Cell-O ve RasMol uygulamaları, proteinler ve amino asitler gibi biyolojik olarak önemli moleküllerin 2B ve 3B animasyonlu modellerini oluşturmanıza yardımcı olur.
Matematiksel modelleme
Büyük mikrobiyoloji verisi koleksiyonları, sayısal olarak analiz edildikten sonra genellikle daha anlamlı bilgiler verir. Matematiksel iyileştirme, bilim adamlarının verilerinin analizi ve modellemesini gerçekleştiren MATLAB, Octave ve SciPy yazılım paketleri. Eğri uydurma, epidemiyolojik tahminler, bakteri üreme simülasyonları ve veri gürültüsü veya stokastik etki eliminasyonu yoluyla parametre tahmini yapmak için bu paketleri kullanın. Bu uygulama aynı zamanda varyans analizi veya Ki-kare testleri gibi istatistiksel hesaplamaları da gerçekleştirir.
Genom Biyoinformatik
Mikrobiyoloji yazılım uygulamaları ayrıca bir mikroorganizmanın DNA'sını oluşturan nükleik asit dizisinden bilgileri görselleştirmenize ve çıkarmanıza yardımcı olur. Açık Biyoinformatik Vakfı, BioJava ve Biopython gibi genom bilgi bankalarından veri çeken, bir organizmanın DNA kodunu ayrıştıran ve diğer DNA örnekleriyle karşılaştıran ücretsiz, açık kaynaklı DNA dizileme ve analiz uygulamaları sağlar. Ek genom analiz paketleri arasında Emboss, HMMER, Clustal Omega, Phylogeny Inference Package veya PHYLIP ve Sequence Manipulation Suite veya SMS bulunur.
Referans Yazılımı
Mikrobiyolojideki bilimsel keşfin hızlı temposu ve değişen hükümet düzenlemeleri, mikrobiyologların çalışmalarını etkileyen bilgilere hazır erişime sahip olmalarını zorunlu kılmaktadır. HUGO, mikrobiyologlara araçlar, kimyasallar, ekipman, kültür ortamı, güvenlik gereksinimleri, yeni organizmalar, taksonomik değişiklikler ve antibiyotikler hakkında güncel bilgiler sağlayan ticari bir yazılım paketidir. Ayrıca gıda bilimi alanında çalışan mikrobiyologlar, Birleşik Krallık, Avustralya ve Amerika Birleşik Devletleri'ndeki devlet kurumları tarafından sağlanan gıda ile ilgili mikrobiyolojik verilere erişmek için ComBase Tarayıcı Web uygulamasını kullanabilir.
