Bazı bilgisayar korsanları eylemlerinin sonuçları hakkında endişelenmeyebilirken, bilgisayar korsanlığının birçok olumsuz etkisi olduğu konusunda çok az tartışma vardır. İşletmeler ve hükümetler, bilgisayar korsanlığından kaynaklanan zararları önlemek için anlatılmamış bir miktar harcıyor. Büyük ölçekli bilgisayar korsanlığı saldırıları, kapsamlı web sitesi hasarına, finansal hasara ve rahatsızlığa neden olur.
Satış Zararları
Bir işletmenin web sitesi saldırıya uğradığında, uzun bir süre çalışmaz hale gelebilir. Bu süre zarfında işletme, web sitesi çalışmadığı için müşteri ve para kaybedebilir. Şirket, web sitesi aracılığıyla ürün satarsa, daha da fazla gelir kaybetmeye eğilimlidir. Bir işletmenin web sitesi ziyaretçilere bulaşırsa, bir kez daha güvenli olsa bile o web sitesini artık ziyaret etmemeyi seçebilirler. Citigroup, web sitesi Haziran 2011'de saldırıya uğradığında 2,7 milyon dolar kaybettiğini söyledi.
Ek masraflar
İşletmeler ve hükümetler ayrıca, saldırıya uğramış web sitelerini geri yüklemeleri için teknisyenlere ödeme yapmak için önemli miktarda para harcamalıdır. PCWorld'e göre, bilgisayar korsanları Nisan 2011'de Sony'nin PlayStation 3 ağına saldırdığında, şirket hasarı gidermek için 170 milyon dolar harcadı. Web sitesi sahipleri, olası bilgisayar korsanlığı saldırılarını önlemek için güvenlik ve koruma önlemleri için de ödeme yapmalıdır.
Veri kaybı
Bilgisayar korsanları bir web sitesine sızdığında, genellikle verileri değiştirir ve yok ederler. Bu verilerin bir kısmı saldırıdan sonra kurtarılabilirken, bir kısmı sonsuza kadar kaybolabilir. Bir işletme veya devlet web sitesinden kaybedilen veriler sayısız zarara ve olumsuz sonuçlara neden olabilir. Örneğin, bir bilgisayar korsanı bir şirketin muhasebe dosyalarını yok ederse, şirket artık kime borçlu olduğunu bilemezdi. En etkileyici rakamlar geçen yıldan geliyor. RSA Security, Mart 2011'de bilgisayar korsanlığı sonucunda ele aldığı 40 milyon çalışan kaydı çalındığında zarar gördü.
Negatif İtibar
Bir şirketin veya devlet kurumunun web sitesi bir bilgisayar korsanının tekrarlanan hedefiyse, önemli ölçüde sık sık kesintiye uğrayabilir. Sonuç olarak, web sitesinin arkasındaki kuruluş olumsuz bir itibar kazanmaya başlayabilir. Bazı tüketiciler, şirketin sitesini kötü tasarladığını, amatör koruma kullandığını ve hatta bir bilgisayar korsanının öfkesini çekmek için bir şeyler yaptığını düşünebilir. Adobe Systems Inc., bilgisayar korsanlarının Ekim 2013'te müşterilerinin hesap kullanıcı adları ve şifrelerinin bir listesini çıkarması sonucu itibar kaybına uğradı.